Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY97

Ssu72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssu72Q9CY97 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ssu72Q9CY97 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ssu72Q9CY97 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ssu72Q9CY97 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ssu72Q9CY97 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms