Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY21

Bud23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, mousemouse

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Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bud23Q9CY21 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bud23Q9CY21 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bud23Q9CY21 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bud23Q9CY21 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bud23Q9CY21 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bud23Q9CY21 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bud23Q9CY21 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bud23Q9CY21 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bud23Q9CY21 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bud23Q9CY21 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bud23Q9CY21 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bud23Q9CY21 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bud23Q9CY21 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bud23Q9CY21 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bud23Q9CY21 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Bud23Q9CY21 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bud23Q9CY21 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bud23Q9CY21 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bud23Q9CY21 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bud23Q9CY21 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bud23Q9CY21 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bud23Q9CY21 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bud23Q9CY21 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bud23Q9CY21 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bud23Q9CY21 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bud23Q9CY21 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Bud23Q9CY21 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bud23Q9CY21 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bud23Q9CY21 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bud23Q9CY21 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Bud23Q9CY21 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Bud23Q9CY21 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Bud23Q9CY21 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Bud23Q9CY21 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Bud23Q9CY21 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bud23Q9CY21 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bud23Q9CY21 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bud23Q9CY21 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bud23Q9CY21 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bud23Q9CY21 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Bud23Q9CY21 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bud23Q9CY21 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bud23Q9CY21 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bud23Q9CY21 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bud23Q9CY21 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bud23Q9CY21 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bud23Q9CY21 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bud23Q9CY21 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bud23Q9CY21 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bud23Q9CY21 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bud23Q9CY21 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
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Bud23Q9CY21 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Bud23Q9CY21 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Bud23Q9CY21 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Bud23Q9CY21 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
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