Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Exo5Q9CXP9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.5 ms