Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms