Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prdm5Q9CXE0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms