Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX00

Ist1, IST1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ist1Q9CX00 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ist1Q9CX00 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms