Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atxn3Q9CVD2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atxn3Q9CVD2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms