Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUI2

4930535I16Rik, RIKEN cDNA 4930535I16 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930535I16RikQ9CUI2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930535I16RikQ9CUI2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms