Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifitm3Q9CQW9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifitm3Q9CQW9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifitm3Q9CQW9 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifitm3Q9CQW9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifitm3Q9CQW9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifitm3Q9CQW9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifitm3Q9CQW9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifitm3Q9CQW9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifitm3Q9CQW9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifitm3Q9CQW9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifitm3Q9CQW9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifitm3Q9CQW9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifitm3Q9CQW9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifitm3Q9CQW9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifitm3Q9CQW9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifitm3Q9CQW9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifitm3Q9CQW9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifitm3Q9CQW9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifitm3Q9CQW9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifitm3Q9CQW9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifitm3Q9CQW9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifitm3Q9CQW9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifitm3Q9CQW9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifitm3Q9CQW9 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifitm3Q9CQW9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifitm3Q9CQW9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifitm3Q9CQW9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifitm3Q9CQW9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifitm3Q9CQW9 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifitm3Q9CQW9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifitm3Q9CQW9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifitm3Q9CQW9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifitm3Q9CQW9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ifitm3Q9CQW9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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