Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp5f1Q9CQQ7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms