Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccer1Q9CQL2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccer1Q9CQL2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccer1Q9CQL2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccer1Q9CQL2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccer1Q9CQL2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccer1Q9CQL2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccer1Q9CQL2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccer1Q9CQL2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccer1Q9CQL2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccer1Q9CQL2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccer1Q9CQL2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccer1Q9CQL2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccer1Q9CQL2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccer1Q9CQL2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccer1Q9CQL2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccer1Q9CQL2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccer1Q9CQL2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccer1Q9CQL2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccer1Q9CQL2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccer1Q9CQL2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccer1Q9CQL2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccer1Q9CQL2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccer1Q9CQL2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccer1Q9CQL2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccer1Q9CQL2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccer1Q9CQL2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccer1Q9CQL2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccer1Q9CQL2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccer1Q9CQL2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccer1Q9CQL2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccer1Q9CQL2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccer1Q9CQL2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccer1Q9CQL2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccer1Q9CQL2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccer1Q9CQL2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccer1Q9CQL2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccer1Q9CQL2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccer1Q9CQL2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccer1Q9CQL2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccer1Q9CQL2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccer1Q9CQL2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccer1Q9CQL2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccer1Q9CQL2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccer1Q9CQL2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccer1Q9CQL2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccer1Q9CQL2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccer1Q9CQL2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccer1Q9CQL2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccer1Q9CQL2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccer1Q9CQL2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccer1Q9CQL2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccer1Q9CQL2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccer1Q9CQL2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccer1Q9CQL2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
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