Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA5

Med4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med4Q9CQA5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Med4Q9CQA5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Med4Q9CQA5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms