Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Commd4Q9CQ02 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms