Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV8

Bcl11b, B-cell lymphoma/leukemia 11B, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11bQ99PV8 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bcl11bQ99PV8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Bcl11bQ99PV8 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bcl11bQ99PV8 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bcl11bQ99PV8 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bcl11bQ99PV8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bcl11bQ99PV8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bcl11bQ99PV8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bcl11bQ99PV8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bcl11bQ99PV8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bcl11bQ99PV8 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bcl11bQ99PV8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bcl11bQ99PV8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bcl11bQ99PV8 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Bcl11bQ99PV8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bcl11bQ99PV8 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bcl11bQ99PV8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bcl11bQ99PV8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bcl11bQ99PV8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bcl11bQ99PV8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bcl11bQ99PV8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bcl11bQ99PV8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bcl11bQ99PV8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bcl11bQ99PV8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bcl11bQ99PV8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bcl11bQ99PV8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bcl11bQ99PV8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bcl11bQ99PV8 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bcl11bQ99PV8 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bcl11bQ99PV8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bcl11bQ99PV8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bcl11bQ99PV8 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bcl11bQ99PV8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bcl11bQ99PV8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bcl11bQ99PV8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bcl11bQ99PV8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bcl11bQ99PV8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bcl11bQ99PV8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bcl11bQ99PV8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bcl11bQ99PV8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bcl11bQ99PV8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bcl11bQ99PV8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bcl11bQ99PV8 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bcl11bQ99PV8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bcl11bQ99PV8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Bcl11bQ99PV8 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bcl11bQ99PV8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bcl11bQ99PV8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bcl11bQ99PV8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bcl11bQ99PV8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bcl11bQ99PV8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bcl11bQ99PV8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bcl11bQ99PV8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bcl11bQ99PV8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bcl11bQ99PV8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bcl11bQ99PV8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bcl11bQ99PV8 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Bcl11bQ99PV8 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bcl11bQ99PV8 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bcl11bQ99PV8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bcl11bQ99PV8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bcl11bQ99PV8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bcl11bQ99PV8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bcl11bQ99PV8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bcl11bQ99PV8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bcl11bQ99PV8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bcl11bQ99PV8 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Bcl11bQ99PV8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Bcl11bQ99PV8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Bcl11bQ99PV8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Bcl11bQ99PV8 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Bcl11bQ99PV8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Bcl11bQ99PV8 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Bcl11bQ99PV8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Bcl11bQ99PV8 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Bcl11bQ99PV8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Bcl11bQ99PV8 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Bcl11bQ99PV8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Bcl11bQ99PV8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bcl11bQ99PV8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bcl11bQ99PV8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bcl11bQ99PV8 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bcl11bQ99PV8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bcl11bQ99PV8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bcl11bQ99PV8 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bcl11bQ99PV8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bcl11bQ99PV8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bcl11bQ99PV8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bcl11bQ99PV8 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bcl11bQ99PV8 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bcl11bQ99PV8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bcl11bQ99PV8 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bcl11bQ99PV8 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bcl11bQ99PV8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bcl11bQ99PV8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bcl11bQ99PV8 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bcl11bQ99PV8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bcl11bQ99PV8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bcl11bQ99PV8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Bcl11bQ99PV8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms