Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlhe41Q99PV5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms