Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim3Q99PE5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim3Q99PE5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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