Protein–RNA interactions for Protein: Q99PA7

4930550L24Rik, MCG117379, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930550L24RikQ99PA7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930550L24RikQ99PA7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930550L24RikQ99PA7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930550L24RikQ99PA7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930550L24RikQ99PA7 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930550L24RikQ99PA7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930550L24RikQ99PA7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930550L24RikQ99PA7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
4930550L24RikQ99PA7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
4930550L24RikQ99PA7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930550L24RikQ99PA7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930550L24RikQ99PA7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930550L24RikQ99PA7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930550L24RikQ99PA7 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930550L24RikQ99PA7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930550L24RikQ99PA7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930550L24RikQ99PA7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930550L24RikQ99PA7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930550L24RikQ99PA7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930550L24RikQ99PA7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930550L24RikQ99PA7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930550L24RikQ99PA7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
4930550L24RikQ99PA7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
4930550L24RikQ99PA7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
4930550L24RikQ99PA7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
4930550L24RikQ99PA7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930550L24RikQ99PA7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms