Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GpnmbQ99P91 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms