Protein–RNA interactions for Protein: Q99P72

Rtn4, Reticulon-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4Q99P72 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rtn4Q99P72 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtn4Q99P72 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms