Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF1

Bco2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco2Q99NF1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bco2Q99NF1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
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