Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sf3b1Q99NB9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sf3b1Q99NB9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sf3b1Q99NB9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sf3b1Q99NB9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sf3b1Q99NB9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sf3b1Q99NB9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sf3b1Q99NB9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sf3b1Q99NB9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sf3b1Q99NB9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sf3b1Q99NB9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sf3b1Q99NB9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sf3b1Q99NB9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sf3b1Q99NB9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sf3b1Q99NB9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sf3b1Q99NB9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sf3b1Q99NB9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b1Q99NB9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b1Q99NB9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b1Q99NB9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b1Q99NB9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b1Q99NB9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b1Q99NB9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b1Q99NB9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b1Q99NB9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b1Q99NB9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b1Q99NB9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b1Q99NB9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b1Q99NB9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b1Q99NB9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b1Q99NB9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b1Q99NB9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b1Q99NB9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b1Q99NB9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b1Q99NB9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b1Q99NB9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b1Q99NB9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3b1Q99NB9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3b1Q99NB9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3b1Q99NB9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3b1Q99NB9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3b1Q99NB9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3b1Q99NB9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3b1Q99NB9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3b1Q99NB9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3b1Q99NB9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3b1Q99NB9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3b1Q99NB9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3b1Q99NB9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3b1Q99NB9 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3b1Q99NB9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3b1Q99NB9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sf3b1Q99NB9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms