Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atoh8Q99NA2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms