Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hdac9Q99N13 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms