Protein–RNA interactions for Protein: Q99ML1

Bbc3, Bcl-2-binding component 3, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbc3Q99ML1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bbc3Q99ML1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bbc3Q99ML1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bbc3Q99ML1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bbc3Q99ML1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bbc3Q99ML1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bbc3Q99ML1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bbc3Q99ML1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbc3Q99ML1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbc3Q99ML1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbc3Q99ML1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbc3Q99ML1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbc3Q99ML1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbc3Q99ML1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbc3Q99ML1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbc3Q99ML1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbc3Q99ML1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbc3Q99ML1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbc3Q99ML1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbc3Q99ML1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbc3Q99ML1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbc3Q99ML1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbc3Q99ML1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbc3Q99ML1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbc3Q99ML1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbc3Q99ML1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbc3Q99ML1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbc3Q99ML1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbc3Q99ML1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbc3Q99ML1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbc3Q99ML1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbc3Q99ML1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbc3Q99ML1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbc3Q99ML1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbc3Q99ML1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbc3Q99ML1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbc3Q99ML1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbc3Q99ML1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbc3Q99ML1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbc3Q99ML1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbc3Q99ML1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbc3Q99ML1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbc3Q99ML1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbc3Q99ML1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbc3Q99ML1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbc3Q99ML1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbc3Q99ML1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbc3Q99ML1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbc3Q99ML1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbc3Q99ML1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbc3Q99ML1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbc3Q99ML1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbc3Q99ML1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbc3Q99ML1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbc3Q99ML1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbc3Q99ML1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbc3Q99ML1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbc3Q99ML1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbc3Q99ML1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbc3Q99ML1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbc3Q99ML1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbc3Q99ML1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbc3Q99ML1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbc3Q99ML1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbc3Q99ML1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbc3Q99ML1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbc3Q99ML1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbc3Q99ML1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbc3Q99ML1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbc3Q99ML1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbc3Q99ML1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbc3Q99ML1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbc3Q99ML1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbc3Q99ML1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbc3Q99ML1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbc3Q99ML1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbc3Q99ML1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbc3Q99ML1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbc3Q99ML1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbc3Q99ML1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbc3Q99ML1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbc3Q99ML1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbc3Q99ML1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbc3Q99ML1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbc3Q99ML1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbc3Q99ML1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbc3Q99ML1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbc3Q99ML1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbc3Q99ML1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbc3Q99ML1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbc3Q99ML1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbc3Q99ML1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbc3Q99ML1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbc3Q99ML1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbc3Q99ML1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbc3Q99ML1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbc3Q99ML1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbc3Q99ML1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbc3Q99ML1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbc3Q99ML1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms