Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtpbp4Q99ME9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms