Protein–RNA interactions for Protein: Q99M28

Rnps1, RNA-binding protein with serine-rich domain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnps1Q99M28 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnps1Q99M28 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms