Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gins4Q99LZ3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms