Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gdpd3Q99LY2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms