Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM2

Cdk5rap3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap3Q99LM2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdk5rap3Q99LM2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms