Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nmd3Q99L48 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms