Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q99KU6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q99KU6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q99KU6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q99KU6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q99KU6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q99KU6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q99KU6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q99KU6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q99KU6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q99KU6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q99KU6 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Q99KU6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q99KU6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q99KU6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q99KU6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q99KU6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q99KU6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q99KU6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q99KU6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q99KU6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q99KU6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q99KU6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q99KU6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Q99KU6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q99KU6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q99KU6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q99KU6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q99KU6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q99KU6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q99KU6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Q99KU6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q99KU6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q99KU6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q99KU6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q99KU6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q99KU6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q99KU6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q99KU6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q99KU6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q99KU6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q99KU6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q99KU6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q99KU6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q99KU6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q99KU6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q99KU6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q99KU6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q99KU6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q99KU6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q99KU6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q99KU6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q99KU6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q99KU6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q99KU6 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q99KU6 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q99KU6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q99KU6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q99KU6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q99KU6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q99KU6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q99KU6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q99KU6 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q99KU6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q99KU6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q99KU6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q99KU6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Q99KU6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q99KU6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q99KU6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q99KU6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q99KU6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q99KU6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q99KU6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q99KU6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q99KU6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q99KU6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q99KU6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q99KU6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q99KU6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q99KU6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q99KU6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q99KU6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q99KU6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q99KU6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q99KU6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q99KU6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q99KU6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q99KU6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q99KU6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q99KU6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q99KU6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q99KU6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q99KU6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q99KU6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q99KU6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q99KU6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q99KU6 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q99KU6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q99KU6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms