Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krcc1Q99JT5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms