Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim11aQ99J19 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim11aQ99J19 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim11aQ99J19 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim11aQ99J19 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim11aQ99J19 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim11aQ99J19 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim11aQ99J19 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim11aQ99J19 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim11aQ99J19 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim11aQ99J19 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim11aQ99J19 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim11aQ99J19 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim11aQ99J19 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim11aQ99J19 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim11aQ99J19 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim11aQ99J19 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim11aQ99J19 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim11aQ99J19 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim11aQ99J19 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim11aQ99J19 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim11aQ99J19 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim11aQ99J19 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim11aQ99J19 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim11aQ99J19 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim11aQ99J19 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim11aQ99J19 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim11aQ99J19 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim11aQ99J19 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim11aQ99J19 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim11aQ99J19 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim11aQ99J19 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim11aQ99J19 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim11aQ99J19 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim11aQ99J19 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim11aQ99J19 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim11aQ99J19 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim11aQ99J19 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim11aQ99J19 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smim11aQ99J19 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smim11aQ99J19 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smim11aQ99J19 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smim11aQ99J19 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smim11aQ99J19 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smim11aQ99J19 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Smim11aQ99J19 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smim11aQ99J19 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smim11aQ99J19 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smim11aQ99J19 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smim11aQ99J19 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smim11aQ99J19 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smim11aQ99J19 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smim11aQ99J19 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smim11aQ99J19 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smim11aQ99J19 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Smim11aQ99J19 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smim11aQ99J19 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Smim11aQ99J19 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smim11aQ99J19 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Smim11aQ99J19 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smim11aQ99J19 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smim11aQ99J19 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smim11aQ99J19 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smim11aQ99J19 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smim11aQ99J19 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smim11aQ99J19 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smim11aQ99J19 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smim11aQ99J19 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim11aQ99J19 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim11aQ99J19 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim11aQ99J19 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim11aQ99J19 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim11aQ99J19 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim11aQ99J19 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim11aQ99J19 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim11aQ99J19 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim11aQ99J19 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim11aQ99J19 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim11aQ99J19 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim11aQ99J19 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim11aQ99J19 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim11aQ99J19 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim11aQ99J19 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim11aQ99J19 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim11aQ99J19 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim11aQ99J19 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim11aQ99J19 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim11aQ99J19 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim11aQ99J19 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim11aQ99J19 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim11aQ99J19 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim11aQ99J19 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim11aQ99J19 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smim11aQ99J19 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smim11aQ99J19 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smim11aQ99J19 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smim11aQ99J19 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smim11aQ99J19 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smim11aQ99J19 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smim11aQ99J19 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms