Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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