Protein–RNA interactions for Protein: Q925E1

Sntg1, Gamma-1-syntrophin, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sntg1Q925E1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sntg1Q925E1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms