Protein–RNA interactions for Protein: Q924W9

Lmo1, Rhombotin-1, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Lmo1Q924W9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmo1Q924W9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmo1Q924W9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmo1Q924W9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmo1Q924W9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmo1Q924W9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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Lmo1Q924W9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmo1Q924W9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmo1Q924W9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Lmo1Q924W9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Lmo1Q924W9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmo1Q924W9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lmo1Q924W9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmo1Q924W9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Lmo1Q924W9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Lmo1Q924W9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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Lmo1Q924W9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Lmo1Q924W9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmo1Q924W9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmo1Q924W9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmo1Q924W9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lmo1Q924W9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Lmo1Q924W9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Lmo1Q924W9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Lmo1Q924W9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Lmo1Q924W9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Lmo1Q924W9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lmo1Q924W9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Lmo1Q924W9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Lmo1Q924W9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Lmo1Q924W9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Lmo1Q924W9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmo1Q924W9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmo1Q924W9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmo1Q924W9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmo1Q924W9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmo1Q924W9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmo1Q924W9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmo1Q924W9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmo1Q924W9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lmo1Q924W9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmo1Q924W9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmo1Q924W9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmo1Q924W9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmo1Q924W9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmo1Q924W9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmo1Q924W9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmo1Q924W9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmo1Q924W9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lmo1Q924W9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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