Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim7Q923T7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms