Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csmd1Q923L3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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