Protein–RNA interactions for Protein: Q923K4

Gtpbp3, tRNA modification GTPase GTPBP3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp3Q923K4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtpbp3Q923K4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtpbp3Q923K4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtpbp3Q923K4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtpbp3Q923K4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtpbp3Q923K4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtpbp3Q923K4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtpbp3Q923K4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtpbp3Q923K4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtpbp3Q923K4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtpbp3Q923K4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtpbp3Q923K4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtpbp3Q923K4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtpbp3Q923K4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtpbp3Q923K4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtpbp3Q923K4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtpbp3Q923K4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtpbp3Q923K4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtpbp3Q923K4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtpbp3Q923K4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtpbp3Q923K4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtpbp3Q923K4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtpbp3Q923K4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtpbp3Q923K4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtpbp3Q923K4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtpbp3Q923K4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtpbp3Q923K4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtpbp3Q923K4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtpbp3Q923K4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtpbp3Q923K4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtpbp3Q923K4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtpbp3Q923K4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtpbp3Q923K4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtpbp3Q923K4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtpbp3Q923K4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtpbp3Q923K4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtpbp3Q923K4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtpbp3Q923K4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtpbp3Q923K4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtpbp3Q923K4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtpbp3Q923K4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtpbp3Q923K4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtpbp3Q923K4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtpbp3Q923K4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtpbp3Q923K4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtpbp3Q923K4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtpbp3Q923K4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtpbp3Q923K4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtpbp3Q923K4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtpbp3Q923K4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtpbp3Q923K4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtpbp3Q923K4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtpbp3Q923K4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtpbp3Q923K4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtpbp3Q923K4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtpbp3Q923K4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtpbp3Q923K4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtpbp3Q923K4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gtpbp3Q923K4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gtpbp3Q923K4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gtpbp3Q923K4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gtpbp3Q923K4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gtpbp3Q923K4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gtpbp3Q923K4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtpbp3Q923K4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtpbp3Q923K4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtpbp3Q923K4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtpbp3Q923K4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtpbp3Q923K4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtpbp3Q923K4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtpbp3Q923K4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtpbp3Q923K4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtpbp3Q923K4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtpbp3Q923K4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtpbp3Q923K4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtpbp3Q923K4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtpbp3Q923K4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtpbp3Q923K4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtpbp3Q923K4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtpbp3Q923K4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtpbp3Q923K4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtpbp3Q923K4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtpbp3Q923K4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtpbp3Q923K4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtpbp3Q923K4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtpbp3Q923K4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtpbp3Q923K4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtpbp3Q923K4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtpbp3Q923K4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtpbp3Q923K4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtpbp3Q923K4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtpbp3Q923K4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtpbp3Q923K4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtpbp3Q923K4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtpbp3Q923K4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtpbp3Q923K4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtpbp3Q923K4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtpbp3Q923K4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtpbp3Q923K4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtpbp3Q923K4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms