Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Clip1Q922J3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Clip1Q922J3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Clip1Q922J3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Clip1Q922J3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Clip1Q922J3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Clip1Q922J3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Clip1Q922J3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Clip1Q922J3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Clip1Q922J3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Clip1Q922J3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Clip1Q922J3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Clip1Q922J3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Clip1Q922J3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Clip1Q922J3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Clip1Q922J3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Clip1Q922J3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Clip1Q922J3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Clip1Q922J3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Clip1Q922J3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Clip1Q922J3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Clip1Q922J3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Clip1Q922J3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Clip1Q922J3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Clip1Q922J3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Clip1Q922J3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Clip1Q922J3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Clip1Q922J3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Clip1Q922J3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Clip1Q922J3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Clip1Q922J3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Clip1Q922J3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Clip1Q922J3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Clip1Q922J3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Clip1Q922J3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Clip1Q922J3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Clip1Q922J3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Clip1Q922J3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Clip1Q922J3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Clip1Q922J3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Clip1Q922J3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Clip1Q922J3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Clip1Q922J3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Clip1Q922J3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Clip1Q922J3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Clip1Q922J3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Clip1Q922J3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Clip1Q922J3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Clip1Q922J3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Clip1Q922J3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Clip1Q922J3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Clip1Q922J3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Clip1Q922J3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Clip1Q922J3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Clip1Q922J3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Clip1Q922J3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Clip1Q922J3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Clip1Q922J3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Clip1Q922J3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Clip1Q922J3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Clip1Q922J3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Clip1Q922J3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Clip1Q922J3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Clip1Q922J3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Clip1Q922J3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Clip1Q922J3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Clip1Q922J3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Clip1Q922J3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Clip1Q922J3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Clip1Q922J3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Clip1Q922J3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Clip1Q922J3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Clip1Q922J3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Clip1Q922J3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Clip1Q922J3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Clip1Q922J3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Clip1Q922J3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Clip1Q922J3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Clip1Q922J3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Clip1Q922J3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Clip1Q922J3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Clip1Q922J3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Clip1Q922J3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Clip1Q922J3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Clip1Q922J3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Clip1Q922J3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Clip1Q922J3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Clip1Q922J3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Clip1Q922J3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Clip1Q922J3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Clip1Q922J3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Clip1Q922J3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Clip1Q922J3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Clip1Q922J3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Clip1Q922J3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Clip1Q922J3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Clip1Q922J3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Clip1Q922J3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Clip1Q922J3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Clip1Q922J3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms