Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tubb6Q922F4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tubb6Q922F4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms