Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ5

Rpe65, Retinoid isomerohydrolase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpe65Q91ZQ5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Rpe65Q91ZQ5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
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Rpe65Q91ZQ5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpe65Q91ZQ5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Rpe65Q91ZQ5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpe65Q91ZQ5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Rpe65Q91ZQ5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpe65Q91ZQ5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Rpe65Q91ZQ5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpe65Q91ZQ5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpe65Q91ZQ5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpe65Q91ZQ5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Rpe65Q91ZQ5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpe65Q91ZQ5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Rpe65Q91ZQ5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpe65Q91ZQ5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Rpe65Q91ZQ5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpe65Q91ZQ5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpe65Q91ZQ5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpe65Q91ZQ5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpe65Q91ZQ5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpe65Q91ZQ5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpe65Q91ZQ5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpe65Q91ZQ5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpe65Q91ZQ5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpe65Q91ZQ5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpe65Q91ZQ5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Rpe65Q91ZQ5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Rpe65Q91ZQ5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpe65Q91ZQ5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Rpe65Q91ZQ5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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