Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK2

Rrp1b, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1bQ91YK2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrp1bQ91YK2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms