Protein–RNA interactions for Protein: Q91YJ2

Snx4, Sorting nexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx4Q91YJ2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx4Q91YJ2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms