Protein–RNA interactions for Protein: Q91X60

Chrna2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna2Q91X60 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Il15ra-205ENSMUST00000114833 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Gm15200-201ENSMUST00000149950 410 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Olfr907-202ENSMUST00000214003 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Olfr907-201ENSMUST00000052901 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Gm43980-201ENSMUST00000204899 1612 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Gm37213-201ENSMUST00000193077 586 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Gm9520-201ENSMUST00000209460 1253 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chrna2Q91X60 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chrna2Q91X60 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chrna2Q91X60 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chrna2Q91X60 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chrna2Q91X60 Olfr181-203ENSMUST00000205742 1104 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chrna2Q91X60 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chrna2Q91X60 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chrna2Q91X60 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chrna2Q91X60 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chrna2Q91X60 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chrna2Q91X60 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chrna2Q91X60 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chrna2Q91X60 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chrna2Q91X60 Hormad1-203ENSMUST00000107154 1444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chrna2Q91X60 Zeb2os-201ENSMUST00000127150 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chrna2Q91X60 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chrna2Q91X60 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Chrna2Q91X60 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chrna2Q91X60 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chrna2Q91X60 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chrna2Q91X60 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chrna2Q91X60 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chrna2Q91X60 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chrna2Q91X60 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chrna2Q91X60 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chrna2Q91X60 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chrna2Q91X60 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chrna2Q91X60 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chrna2Q91X60 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chrna2Q91X60 4930459L07Rik-201ENSMUST00000199751 420 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chrna2Q91X60 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Chrna2Q91X60 CT009713.1-201ENSMUST00000224828 853 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Chrna2Q91X60 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chrna2Q91X60 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chrna2Q91X60 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chrna2Q91X60 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chrna2Q91X60 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chrna2Q91X60 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chrna2Q91X60 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chrna2Q91X60 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chrna2Q91X60 Gm38262-201ENSMUST00000194760 1382 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Chrna2Q91X60 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chrna2Q91X60 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chrna2Q91X60 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chrna2Q91X60 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chrna2Q91X60 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chrna2Q91X60 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms