Protein–RNA interactions for Protein: Q91VH2

Snx9, Sorting nexin-9, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx9Q91VH2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snx9Q91VH2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snx9Q91VH2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx9Q91VH2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms