Protein–RNA interactions for Protein: Q8VI88

Odf4, Outer dense fiber protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf4Q8VI88 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms