Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHT7

Gtf3a, Transcription factor IIIA, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3aQ8VHT7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3aQ8VHT7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3aQ8VHT7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3aQ8VHT7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3aQ8VHT7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3aQ8VHT7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3aQ8VHT7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3aQ8VHT7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3aQ8VHT7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3aQ8VHT7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3aQ8VHT7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3aQ8VHT7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3aQ8VHT7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3aQ8VHT7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3aQ8VHT7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3aQ8VHT7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3aQ8VHT7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3aQ8VHT7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3aQ8VHT7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3aQ8VHT7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3aQ8VHT7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3aQ8VHT7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3aQ8VHT7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3aQ8VHT7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3aQ8VHT7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3aQ8VHT7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3aQ8VHT7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3aQ8VHT7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3aQ8VHT7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3aQ8VHT7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3aQ8VHT7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3aQ8VHT7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3aQ8VHT7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3aQ8VHT7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gtf3aQ8VHT7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gtf3aQ8VHT7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gtf3aQ8VHT7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3aQ8VHT7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3aQ8VHT7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3aQ8VHT7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3aQ8VHT7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3aQ8VHT7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3aQ8VHT7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3aQ8VHT7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3aQ8VHT7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3aQ8VHT7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3aQ8VHT7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3aQ8VHT7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3aQ8VHT7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3aQ8VHT7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3aQ8VHT7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3aQ8VHT7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3aQ8VHT7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3aQ8VHT7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3aQ8VHT7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3aQ8VHT7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3aQ8VHT7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3aQ8VHT7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3aQ8VHT7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3aQ8VHT7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3aQ8VHT7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3aQ8VHT7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3aQ8VHT7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3aQ8VHT7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3aQ8VHT7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3aQ8VHT7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3aQ8VHT7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3aQ8VHT7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3aQ8VHT7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3aQ8VHT7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3aQ8VHT7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3aQ8VHT7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3aQ8VHT7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3aQ8VHT7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3aQ8VHT7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3aQ8VHT7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3aQ8VHT7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3aQ8VHT7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3aQ8VHT7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3aQ8VHT7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3aQ8VHT7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3aQ8VHT7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3aQ8VHT7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3aQ8VHT7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3aQ8VHT7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3aQ8VHT7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3aQ8VHT7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3aQ8VHT7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3aQ8VHT7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3aQ8VHT7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3aQ8VHT7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3aQ8VHT7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3aQ8VHT7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3aQ8VHT7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3aQ8VHT7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf3aQ8VHT7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf3aQ8VHT7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf3aQ8VHT7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf3aQ8VHT7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf3aQ8VHT7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms