Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK2

Rhbdd2, Rhomboid domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd2Q8VEK2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rhbdd2Q8VEK2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Rhbdd2Q8VEK2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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