Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ3

Dkk4, Dickkopf-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk4Q8VEJ3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms